Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms