Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LtbP41155 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LtbP41155 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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LtbP41155 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LtbP41155 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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LtbP41155 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LtbP41155 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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