Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms