Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxa10P31310 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms