Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pabpc1P29341 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pabpc1P29341 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms