Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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