Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8P23463 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms