Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P20040 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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