Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms