Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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H2-Eb1P04230 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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H2-Eb1P04230 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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