Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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