Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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