Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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