Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rnf6Q9DBU5 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rnf6Q9DBU5 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rnf6Q9DBU5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rnf6Q9DBU5 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rnf6Q9DBU5 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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