Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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