Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ChfrQ810L3 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms