Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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