Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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