Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ttc21bQ0HA38 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms