Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms