Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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