Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PtprmP28828 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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PtprmP28828 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
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