Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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