Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms