Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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