Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms