Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms