Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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