Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2035J3QP87 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2035J3QP87 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms