Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Clrn2B2RVW2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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