Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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