Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms