Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcniQ9Z2V9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcniQ9Z2V9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms