Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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