Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms