Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms