Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip6Q9Z1Y4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms