Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr5Q9Z1P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms