Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms