Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms