Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41l3Q9WV92 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms