Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms