Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SnurfQ9WU12 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms