Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrf1Q9WU00 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms