Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp18Q9WTV6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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