Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2l3Q9WTM4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms