Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6cQ9WTM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms