Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam50bQ9WTJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms