Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc2Q9R244 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms