Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms